Ενώ σε δηλώσεις του στις 27 Νοεμβρίου του 2008 καταδίκαζε τον ηγούμενο Εφραίμ και τον μοναχό Αρσένιο στην Εξεταστική Επιτροπή της Βουλής λέγοντας ότι : «Οι δύο αυτοί κύριοι πρέπει να περάσουν, από τα κελιά του μοναστηρίου, στα κελιά των φυλακών».
Τώρα ζητεί «συγχώρεση και άφεση αμαρτιών» και από «πολέμιος» του ηγούμενου Εφραίμ γίνεται υποστηρικτής του. Κατά την διάρκεια της επίσκεψής του το Σάββατο στην Ιερή Μονή Βατοπεδίου έκανε στροφή 180ο μοιρών και άλλαξε ξαφνικά άποψη για τους αυτουργούς της «Μονής Βαλτοπεδίου»- κατά τα λεγόμενα του, λέγοντας ότι : «Δεν μπορεί να αθωώνονται πολιτικοί και να κάθονται στο εδώλιο του κατηγορούμενου οι μοναχοί. Είναι οξύμωρο και δεν είναι και σωστό».
Και ξεκαθάρισε ότι : «η Μονή είναι Νομικό πρόσωπο Δημοσίου Δικαίου και δεν έχει διαφορά με το Δημόσιο, το οποίο γι’ αυτό και για άλλους λόγους, δεν υπέστη καμία ζημιά»
Τι κρύβει η ξαφνική μετάνοια του κ. Καρατζαφέρη;
Για ποιο λόγο ζήτησε συγχωροχάρτι από τον άλλοτε «πολέμιο» του;